利用肠道微生物多形拟杆菌制备寡糖活性结构域的研究文献综述

 2022-12-22 19:54:28

开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)

  1. 研究背景

随着生物学的不断发展,生命的奥秘逐渐显现在人们眼前。在宏基因组学的不断发展下,微生物的基因测序方法有了新的改变,人们可以无需培养直接测量环境中微生物的基因。对于此前人体中难以检测的微生物,宏基因组学和宏转录组学带来了新的进展。现有研究表明,肠道微生物对宿主的代谢,情绪等多个方面都有着一定的影响。

拟杆菌属作为肠道菌群的组成部分,对于肠道菌群的功能有着重要的作用。通过宏基因组学的分析,发现拟杆菌属可以表达大量与多糖降解有关的酶。日常生活中,人每天都会摄取一定量的膳食纤维,而人体中缺乏降解相关多糖的酶,但肠道菌群中的部分细菌可以利用这些多糖产生短链脂肪酸等其他相关活性物质来影响宿主的功能。

海洋真菌多糖(YCP)是从一种海洋丝状真菌中提取的多糖分子,具有良好的免疫调节活性。为研究该多糖分子的功能与结构域的关系,需要对多糖进行降解获得具有不同结构域的分子片段。目前常用的降解方法有物理降解法、化学降解法和生物降解法;但不同方法获得的片段是有局限的。理化方法在降解过程中有较多副反应,且反应条件较难控制,降解效率较低。而常规酶解法仅用单一酶不适合复杂多糖的降解。人体内多糖的利用主通过肠道微生物实现,研究表明,拟杆菌门含大量碳水化合物活性酶基因,具有较强的利用多糖的能力。革兰阴性多形拟杆菌是拟杆菌门的代表,在肠道内分布广泛,目前已完成全基因组测序,这种菌在人类和小鼠中含量差异甚微,初步研究发现多形拟杆菌对海洋真菌多糖生长利用速率很快。为反映体内生物代谢的过程,利用多形拟杆菌降解YCP获取结构域分子是一种可行的方法。

二、研究目的及意义

本课题将利用人体肠道菌中的拟杆菌门模式菌多形拟杆菌降解海洋真菌多糖YCP,获得不同的多糖结构域片段并对其进行解析。旨在建立检测多糖结构域的方法,利用菌解法在明确降解途径的基础上,开发出一种可获得一系列不同多糖结构域并对其进行解析的方法。

三、实验内容

本课题在前期研究的基础上,采用多形拟杆菌降解海洋真菌多糖YCP,结合各种仪器分析手段,以获得海洋真菌多糖结构域片段;并对得到的结构域片段开展初步活性筛选研究,主要内容包括:

1. 海洋真菌多糖YCP的制备、纯化与理化性质鉴定;

2. 利用多形拟杆菌制备海洋真菌多糖活性结构域方法的建立;

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